Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrfip1Q3UZ39 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrfip1Q3UZ39 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrfip1Q3UZ39 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms