Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trat1Q3UU67 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trat1Q3UU67 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms