Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem35bQ3U0Y2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem35bQ3U0Y2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem35bQ3U0Y2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem35bQ3U0Y2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms