Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3TQQ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3TQQ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3TQQ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3TQQ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms