Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col24a1Q30D77 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col24a1Q30D77 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col24a1Q30D77 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col24a1Q30D77 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col24a1Q30D77 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col24a1Q30D77 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col24a1Q30D77 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col24a1Q30D77 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col24a1Q30D77 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.1 ms