Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd300lgQ1ERP8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300lgQ1ERP8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lgQ1ERP8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd300lgQ1ERP8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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