Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc7a1Q09143 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc7a1Q09143 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc7a1Q09143 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc7a1Q09143 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc7a1Q09143 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms