Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnn2Q08093 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnn2Q08093 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnn2Q08093 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnn2Q08093 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms