Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk18Q04899 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk18Q04899 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms