Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcr5Q04683 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcr5Q04683 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcr5Q04683 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cxcr5Q04683 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cxcr5Q04683 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms