Protein–RNA interactions for Protein: Q03311

Bche, Cholinesterase, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcheQ03311 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcheQ03311 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcheQ03311 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcheQ03311 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BcheQ03311 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcheQ03311 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcheQ03311 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BcheQ03311 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BcheQ03311 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcheQ03311 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcheQ03311 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcheQ03311 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcheQ03311 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcheQ03311 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BcheQ03311 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcheQ03311 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcheQ03311 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcheQ03311 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcheQ03311 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcheQ03311 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BcheQ03311 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcheQ03311 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcheQ03311 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BcheQ03311 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcheQ03311 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcheQ03311 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcheQ03311 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BcheQ03311 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcheQ03311 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcheQ03311 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BcheQ03311 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcheQ03311 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BcheQ03311 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BcheQ03311 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BcheQ03311 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcheQ03311 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BcheQ03311 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcheQ03311 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcheQ03311 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BcheQ03311 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BcheQ03311 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BcheQ03311 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcheQ03311 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcheQ03311 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcheQ03311 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcheQ03311 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcheQ03311 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BcheQ03311 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms