Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Top2aQ01320 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Top2aQ01320 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Top2aQ01320 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Top2aQ01320 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Top2aQ01320 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Top2aQ01320 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Top2aQ01320 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Top2aQ01320 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Top2aQ01320 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Top2aQ01320 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Top2aQ01320 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Top2aQ01320 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Top2aQ01320 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Top2aQ01320 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Top2aQ01320 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Top2aQ01320 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Top2aQ01320 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Top2aQ01320 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Top2aQ01320 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Top2aQ01320 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Top2aQ01320 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Top2aQ01320 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms