Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Serpina1cQ00896 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Serpina1cQ00896 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Serpina1cQ00896 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Serpina1cQ00896 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Serpina1cQ00896 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Serpina1cQ00896 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Serpina1cQ00896 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Serpina1cQ00896 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Serpina1cQ00896 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Serpina1cQ00896 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms