Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VegfaQ00731 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VegfaQ00731 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VegfaQ00731 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VegfaQ00731 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfaQ00731 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfaQ00731 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfaQ00731 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfaQ00731 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfaQ00731 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfaQ00731 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfaQ00731 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfaQ00731 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfaQ00731 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfaQ00731 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfaQ00731 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms