Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmb4P99026 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmb4P99026 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmb4P99026 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmb4P99026 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmb4P99026 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmb4P99026 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmb4P99026 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmb4P99026 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Psmb4P99026 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb4P99026 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb4P99026 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb4P99026 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms