Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gbx1P82976 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbx1P82976 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbx1P82976 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbx1P82976 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbx1P82976 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbx1P82976 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms