Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TgfbiP82198 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TgfbiP82198 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TgfbiP82198 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TgfbiP82198 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms