Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Stx4P70452 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Stx4P70452 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,98■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,98■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Stx4P70452 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19,95■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19,95■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19,95■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19,94■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19,94■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19,92■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Stx4P70452 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19,9■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,78
Stx4P70452 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,89■□□□□ 0,77
Stx4P70452 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Stx4P70452 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Stx4P70452 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19,85■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Stx4P70452 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Stx4P70452 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,83■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19,83■□□□□ 0,77
Stx4P70452 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
Stx4P70452 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
Stx4P70452 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,83■□□□□ 0,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,5 ms