Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53bp1P70399 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53bp1P70399 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tp53bp1P70399 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms