Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acta1P68134 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acta1P68134 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acta1P68134 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acta1P68134 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acta1P68134 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acta1P68134 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Acta1P68134 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acta1P68134 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acta1P68134 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acta1P68134 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Acta1P68134 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acta1P68134 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 319.4 ms