Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng7P62956 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacng7P62956 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacng7P62956 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacng7P62956 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms