Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhobP62746 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhobP62746 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhobP62746 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhobP62746 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RhobP62746 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RhobP62746 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhobP62746 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhobP62746 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhobP62746 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhobP62746 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhobP62746 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhobP62746 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhobP62746 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhobP62746 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhobP62746 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RhobP62746 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhobP62746 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhobP62746 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhobP62746 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RhobP62746 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhobP62746 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhobP62746 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhobP62746 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhobP62746 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhobP62746 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhobP62746 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhobP62746 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhobP62746 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhobP62746 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RhobP62746 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RhobP62746 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhobP62746 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhobP62746 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhobP62746 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RhobP62746 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhobP62746 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhobP62746 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhobP62746 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhobP62746 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhobP62746 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhobP62746 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhobP62746 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhobP62746 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhobP62746 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhobP62746 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhobP62746 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhobP62746 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhobP62746 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhobP62746 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhobP62746 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhobP62746 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhobP62746 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhobP62746 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhobP62746 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RhobP62746 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RhobP62746 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhobP62746 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhobP62746 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhobP62746 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhobP62746 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhobP62746 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhobP62746 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhobP62746 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhobP62746 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhobP62746 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhobP62746 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhobP62746 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhobP62746 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhobP62746 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhobP62746 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhobP62746 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhobP62746 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhobP62746 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhobP62746 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhobP62746 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RhobP62746 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhobP62746 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhobP62746 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhobP62746 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhobP62746 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhobP62746 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhobP62746 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhobP62746 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhobP62746 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhobP62746 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhobP62746 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhobP62746 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhobP62746 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhobP62746 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhobP62746 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhobP62746 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhobP62746 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhobP62746 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhobP62746 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RhobP62746 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhobP62746 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhobP62746 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhobP62746 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhobP62746 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms