Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snrpd3P62320 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd3P62320 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpd3P62320 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms