Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps11P62281 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps11P62281 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps11P62281 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps11P62281 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps11P62281 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps11P62281 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps11P62281 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps11P62281 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps11P62281 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps11P62281 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps11P62281 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms