Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rp1P56716 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rp1P56716 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rp1P56716 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1P56716 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rp1P56716 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rp1P56716 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rp1P56716 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rp1P56716 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rp1P56716 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rp1P56716 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms