Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PolgP54099 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PolgP54099 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PolgP54099 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PolgP54099 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PolgP54099 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PolgP54099 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PolgP54099 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PolgP54099 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PolgP54099 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PolgP54099 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PolgP54099 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PolgP54099 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PolgP54099 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PolgP54099 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PolgP54099 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PolgP54099 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PolgP54099 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PolgP54099 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PolgP54099 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PolgP54099 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PolgP54099 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PolgP54099 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PolgP54099 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PolgP54099 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PolgP54099 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PolgP54099 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PolgP54099 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PolgP54099 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PolgP54099 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PolgP54099 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PolgP54099 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PolgP54099 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PolgP54099 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PolgP54099 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PolgP54099 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PolgP54099 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PolgP54099 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PolgP54099 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PolgP54099 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PolgP54099 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PolgP54099 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PolgP54099 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PolgP54099 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PolgP54099 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PolgP54099 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PolgP54099 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolgP54099 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolgP54099 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolgP54099 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolgP54099 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolgP54099 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolgP54099 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolgP54099 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolgP54099 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolgP54099 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PolgP54099 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PolgP54099 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PolgP54099 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PolgP54099 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PolgP54099 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PolgP54099 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PolgP54099 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PolgP54099 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PolgP54099 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PolgP54099 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PolgP54099 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PolgP54099 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PolgP54099 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PolgP54099 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PolgP54099 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PolgP54099 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PolgP54099 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PolgP54099 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PolgP54099 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PolgP54099 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PolgP54099 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PolgP54099 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PolgP54099 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolgP54099 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolgP54099 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolgP54099 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolgP54099 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolgP54099 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolgP54099 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolgP54099 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolgP54099 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolgP54099 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolgP54099 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolgP54099 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PolgP54099 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PolgP54099 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolgP54099 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolgP54099 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolgP54099 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolgP54099 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PolgP54099 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PolgP54099 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PolgP54099 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PolgP54099 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms