Protein–RNA interactions for Protein: P53941

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IMP4P53941 CDC3YLR314C 1563 nt7.5□□□□□ -1.21
IMP4P53941 PLB3YOL011W 2061 nt7.49□□□□□ -1.21
IMP4P53941 BUD31YCR063W 474 nt7.49□□□□□ -1.21
IMP4P53941 HXT9YJL219W 1704 nt7.49□□□□□ -1.21
IMP4P53941 YER152CYER152C 1332 nt7.48□□□□□ -1.21
IMP4P53941 POB3YML069W 1659 nt7.47□□□□□ -1.21
IMP4P53941 STE3YKL178C 1413 nt7.47□□□□□ -1.21
IMP4P53941 PSA1YDL055C 1086 nt7.47□□□□□ -1.21
IMP4P53941 ADH6YMR318C 1083 nt7.47□□□□□ -1.21
IMP4P53941 ATO2YNR002C 849 nt7.47□□□□□ -1.21
IMP4P53941 INP54YOL065C 1155 nt7.46□□□□□ -1.22
IMP4P53941 OSM1YJR051W 1506 nt7.46□□□□□ -1.22
IMP4P53941 DIP5YPL265W 1827 nt7.45□□□□□ -1.22
IMP4P53941 HXT13YEL069C 1695 nt7.45□□□□□ -1.22
IMP4P53941 ARO3YDR035W 1113 nt7.45□□□□□ -1.22
IMP4P53941 CYS3YAL012W 1185 nt7.45□□□□□ -1.22
IMP4P53941 ZIM17YNL310C 525 nt7.45□□□□□ -1.22
IMP4P53941 INO1YJL153C 1602 nt7.45□□□□□ -1.22
IMP4P53941 PIL1YGR086C 1020 nt7.44□□□□□ -1.22
IMP4P53941 PRY2YKR013W 990 nt7.44□□□□□ -1.22
IMP4P53941 MBF1YOR298C-A 456 nt7.44□□□□□ -1.22
IMP4P53941 TIF3YPR163C 1311 nt7.44□□□□□ -1.22
IMP4P53941 YNL295WYNL295W 1575 nt7.43□□□□□ -1.22
IMP4P53941 TGL5YOR081C 2250 nt7.42□□□□□ -1.22
IMP4P53941 YPT10YBR264C 600 nt7.42□□□□□ -1.22
IMP4P53941 MCM5YLR274W 2328 nt7.42□□□□□ -1.22
IMP4P53941 SNP1YIL061C 903 nt7.41□□□□□ -1.22
IMP4P53941 YMR074CYMR074C 438 nt7.41□□□□□ -1.22
IMP4P53941 DSC3YOR223W 879 nt7.41□□□□□ -1.22
IMP4P53941 WSC4YHL028W 1818 nt7.41□□□□□ -1.22
IMP4P53941 HIS3YOR202W 663 nt7.4□□□□□ -1.22
IMP4P53941 DML1YMR211W 1428 nt7.4□□□□□ -1.22
IMP4P53941 GLY1YEL046C 1164 nt7.39□□□□□ -1.23
IMP4P53941 PAM17YKR065C 594 nt7.39□□□□□ -1.23
IMP4P53941 YML122CYML122C 381 nt7.39□□□□□ -1.23
IMP4P53941 GAL83YER027C 1254 nt7.38□□□□□ -1.23
IMP4P53941 INM1YHR046C 888 nt7.38□□□□□ -1.23
IMP4P53941 SML1YML058W 315 nt7.38□□□□□ -1.23
IMP4P53941 MRP7YNL005C 1116 nt7.38□□□□□ -1.23
IMP4P53941 ALG7YBR243C 1347 nt7.37□□□□□ -1.23
IMP4P53941 MPH3YJR160C 1809 nt7.37□□□□□ -1.23
IMP4P53941 GET2YER083C 858 nt7.37□□□□□ -1.23
IMP4P53941 ABP1YCR088W 1779 nt7.37□□□□□ -1.23
IMP4P53941 AFG2YLR397C 2343 nt7.36□□□□□ -1.23
IMP4P53941 YPQ2YDR352W 954 nt7.36□□□□□ -1.23
IMP4P53941 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.36□□□□□ -1.23
IMP4P53941 SUN4YNL066W 1263 nt7.36□□□□□ -1.23
IMP4P53941 SPS1YDR523C 1473 nt7.36□□□□□ -1.23
IMP4P53941 MSB3YNL293W 1902 nt7.35□□□□□ -1.23
IMP4P53941 ERG10YPL028W 1197 nt7.35□□□□□ -1.23
IMP4P53941 BIO3YNR058W 1443 nt7.35□□□□□ -1.23
IMP4P53941 MAS1YLR163C 1389 nt7.34□□□□□ -1.23
IMP4P53941 CYS4YGR155W 1524 nt7.34□□□□□ -1.23
IMP4P53941 DST1YGL043W 930 nt7.34□□□□□ -1.23
IMP4P53941 YNL140CYNL140C 570 nt7.34□□□□□ -1.23
IMP4P53941 NFS1YCL017C 1494 nt7.33□□□□□ -1.24
IMP4P53941 TUB1YML085C 1344 nt7.32□□□□□ -1.24
IMP4P53941 FCP1YMR277W 2199 nt7.32□□□□□ -1.24
IMP4P53941 PMP3YDR276C 168 nt7.32□□□□□ -1.24
IMP4P53941 PPZ2YDR436W 2133 nt7.32□□□□□ -1.24
IMP4P53941 YPL136WYPL136W 369 nt7.32□□□□□ -1.24
IMP4P53941 NME1NME1 340 nt7.32□□□□□ -1.24
IMP4P53941 CCR4YAL021C 2514 nt7.32□□□□□ -1.24
IMP4P53941 FCY22YER060W-A 1593 nt7.31□□□□□ -1.24
IMP4P53941 YER137CYER137C 447 nt7.31□□□□□ -1.24
IMP4P53941 YHR033WYHR033W 1272 nt7.31□□□□□ -1.24
IMP4P53941 MAM3YOL060C 2121 nt7.31□□□□□ -1.24
IMP4P53941 SGF73YGL066W 1974 nt7.31□□□□□ -1.24
IMP4P53941 ADE2YOR128C 1716 nt7.3□□□□□ -1.24
IMP4P53941 SKP1YDR328C 585 nt7.3□□□□□ -1.24
IMP4P53941 YJL213WYJL213W 996 nt7.3□□□□□ -1.24
IMP4P53941 YLR162WYLR162W 357 nt7.3□□□□□ -1.24
IMP4P53941 LDB7YBL006C 543 nt7.3□□□□□ -1.24
IMP4P53941 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.29□□□□□ -1.24
IMP4P53941 YLR184WYLR184W 348 nt7.29□□□□□ -1.24
IMP4P53941 NAF1YNL124W 1479 nt7.29□□□□□ -1.24
IMP4P53941 DCR2YLR361C 1737 nt7.28□□□□□ -1.24
IMP4P53941 snR30snR30 606 nt7.28□□□□□ -1.24
IMP4P53941 MET13YGL125W 1803 nt7.28□□□□□ -1.24
IMP4P53941 BNA3YJL060W 1335 nt7.27□□□□□ -1.24
IMP4P53941 AOS1YPR180W 1044 nt7.27□□□□□ -1.25
IMP4P53941 COX15YER141W 1461 nt7.25□□□□□ -1.25
IMP4P53941 KTR4YBR199W 1395 nt7.25□□□□□ -1.25
IMP4P53941 RSC9YML127W 1746 nt7.25□□□□□ -1.25
IMP4P53941 OPI7YDR360W 435 nt7.25□□□□□ -1.25
IMP4P53941 AIM20YIL158W 615 nt7.25□□□□□ -1.25
IMP4P53941 HOC1YJR075W 1191 nt7.25□□□□□ -1.25
IMP4P53941 MRN1YPL184C 1839 nt7.24□□□□□ -1.25
IMP4P53941 SNU66YOR308C 1764 nt7.24□□□□□ -1.25
IMP4P53941 HAM1YJR069C 594 nt7.24□□□□□ -1.25
IMP4P53941 LIA1YJR070C 978 nt7.24□□□□□ -1.25
IMP4P53941 CIT2YCR005C 1383 nt7.23□□□□□ -1.25
IMP4P53941 GPD1YDL022W 1176 nt7.23□□□□□ -1.25
IMP4P53941 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.23□□□□□ -1.25
IMP4P53941 PEX28YHR150W 1740 nt7.23□□□□□ -1.25
IMP4P53941 OPI1YHL020C 1215 nt7.22□□□□□ -1.25
IMP4P53941 YLR030WYLR030W 792 nt7.22□□□□□ -1.25
IMP4P53941 YOL046CYOL046C 675 nt7.22□□□□□ -1.25
IMP4P53941 TRR1YDR353W 960 nt7.21□□□□□ -1.26
IMP4P53941 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.7 ms