Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PitpnbP53811 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PitpnbP53811 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PitpnbP53811 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PitpnbP53811 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms