Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TubP50586 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TubP50586 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TubP50586 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TubP50586 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TubP50586 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TubP50586 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TubP50586 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TubP50586 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TubP50586 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TubP50586 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TubP50586 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TubP50586 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TubP50586 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TubP50586 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TubP50586 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TubP50586 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TubP50586 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TubP50586 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TubP50586 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TubP50586 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TubP50586 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TubP50586 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TubP50586 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TubP50586 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TubP50586 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TubP50586 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TubP50586 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TubP50586 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TubP50586 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TubP50586 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TubP50586 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TubP50586 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TubP50586 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TubP50586 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TubP50586 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TubP50586 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TubP50586 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TubP50586 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TubP50586 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TubP50586 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TubP50586 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TubP50586 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TubP50586 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TubP50586 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TubP50586 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TubP50586 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TubP50586 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TubP50586 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TubP50586 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TubP50586 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TubP50586 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TubP50586 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TubP50586 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TubP50586 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TubP50586 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TubP50586 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TubP50586 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TubP50586 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TubP50586 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TubP50586 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TubP50586 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TubP50586 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TubP50586 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TubP50586 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TubP50586 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TubP50586 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TubP50586 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TubP50586 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TubP50586 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TubP50586 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TubP50586 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TubP50586 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TubP50586 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TubP50586 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TubP50586 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TubP50586 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TubP50586 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TubP50586 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TubP50586 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TubP50586 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TubP50586 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TubP50586 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TubP50586 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TubP50586 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TubP50586 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TubP50586 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TubP50586 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TubP50586 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TubP50586 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TubP50586 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TubP50586 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TubP50586 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TubP50586 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TubP50586 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TubP50586 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TubP50586 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TubP50586 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TubP50586 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TubP50586 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms