Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rph3aP47708 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rph3aP47708 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rph3aP47708 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rph3aP47708 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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