Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NodalP43021 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NodalP43021 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NodalP43021 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NodalP43021 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NodalP43021 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NodalP43021 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NodalP43021 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NodalP43021 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NodalP43021 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NodalP43021 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NodalP43021 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NodalP43021 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NodalP43021 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NodalP43021 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NodalP43021 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NodalP43021 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NodalP43021 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NodalP43021 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NodalP43021 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NodalP43021 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NodalP43021 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NodalP43021 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NodalP43021 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NodalP43021 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NodalP43021 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NodalP43021 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NodalP43021 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NodalP43021 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NodalP43021 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NodalP43021 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NodalP43021 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NodalP43021 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NodalP43021 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NodalP43021 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NodalP43021 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NodalP43021 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NodalP43021 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NodalP43021 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NodalP43021 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NodalP43021 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NodalP43021 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NodalP43021 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NodalP43021 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NodalP43021 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NodalP43021 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NodalP43021 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NodalP43021 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NodalP43021 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NodalP43021 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NodalP43021 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NodalP43021 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NodalP43021 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NodalP43021 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NodalP43021 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NodalP43021 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NodalP43021 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NodalP43021 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NodalP43021 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NodalP43021 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NodalP43021 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NodalP43021 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NodalP43021 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NodalP43021 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NodalP43021 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NodalP43021 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NodalP43021 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NodalP43021 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NodalP43021 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NodalP43021 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NodalP43021 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NodalP43021 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NodalP43021 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NodalP43021 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NodalP43021 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NodalP43021 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NodalP43021 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NodalP43021 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NodalP43021 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NodalP43021 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NodalP43021 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NodalP43021 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NodalP43021 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NodalP43021 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NodalP43021 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NodalP43021 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NodalP43021 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NodalP43021 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NodalP43021 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NodalP43021 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NodalP43021 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NodalP43021 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NodalP43021 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NodalP43021 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NodalP43021 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NodalP43021 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NodalP43021 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NodalP43021 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NodalP43021 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NodalP43021 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms