Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ifnar1P33896 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ifnar1P33896 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ifnar1P33896 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms