Protein–RNA interactions for Protein: P27889

Hnf1b, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf1bP27889 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hnf1bP27889 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hnf1bP27889 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hnf1bP27889 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hnf1bP27889 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hnf1bP27889 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hnf1bP27889 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Hnf1bP27889 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnf1bP27889 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hnf1bP27889 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnf1bP27889 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hnf1bP27889 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms