Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabra2P26048 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabra2P26048 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabra2P26048 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gabra2P26048 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms