Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HdcP23738 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HdcP23738 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HdcP23738 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HdcP23738 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HdcP23738 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HdcP23738 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HdcP23738 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HdcP23738 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HdcP23738 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HdcP23738 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HdcP23738 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HdcP23738 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HdcP23738 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HdcP23738 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HdcP23738 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HdcP23738 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HdcP23738 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HdcP23738 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HdcP23738 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HdcP23738 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HdcP23738 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HdcP23738 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HdcP23738 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HdcP23738 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HdcP23738 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HdcP23738 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HdcP23738 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HdcP23738 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HdcP23738 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HdcP23738 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HdcP23738 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HdcP23738 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HdcP23738 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HdcP23738 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HdcP23738 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HdcP23738 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HdcP23738 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HdcP23738 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HdcP23738 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HdcP23738 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HdcP23738 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HdcP23738 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HdcP23738 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HdcP23738 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HdcP23738 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HdcP23738 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HdcP23738 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HdcP23738 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HdcP23738 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HdcP23738 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HdcP23738 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HdcP23738 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HdcP23738 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HdcP23738 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HdcP23738 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HdcP23738 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HdcP23738 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HdcP23738 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HdcP23738 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HdcP23738 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HdcP23738 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HdcP23738 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HdcP23738 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HdcP23738 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HdcP23738 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HdcP23738 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HdcP23738 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HdcP23738 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HdcP23738 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HdcP23738 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HdcP23738 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HdcP23738 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HdcP23738 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HdcP23738 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HdcP23738 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HdcP23738 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HdcP23738 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HdcP23738 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HdcP23738 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HdcP23738 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HdcP23738 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HdcP23738 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HdcP23738 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HdcP23738 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HdcP23738 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HdcP23738 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HdcP23738 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HdcP23738 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HdcP23738 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HdcP23738 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HdcP23738 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HdcP23738 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HdcP23738 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HdcP23738 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HdcP23738 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HdcP23738 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HdcP23738 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HdcP23738 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HdcP23738 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms