Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja1P23242 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja1P23242 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja1P23242 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja1P23242 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja1P23242 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja1P23242 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja1P23242 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja1P23242 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja1P23242 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja1P23242 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gja1P23242 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja1P23242 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja1P23242 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja1P23242 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms