Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tap1P21958 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tap1P21958 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tap1P21958 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tap1P21958 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Tap1P21958 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tap1P21958 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tap1P21958 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tap1P21958 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tap1P21958 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tap1P21958 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tap1P21958 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tap1P21958 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tap1P21958 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tap1P21958 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tap1P21958 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms