Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30aP15533 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30aP15533 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim30aP15533 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim30aP15533 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms