Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh2P15116 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh2P15116 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh2P15116 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh2P15116 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh2P15116 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdh2P15116 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh2P15116 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh2P15116 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh2P15116 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh2P15116 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh2P15116 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh2P15116 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh2P15116 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh2P15116 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh2P15116 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdh2P15116 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh2P15116 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh2P15116 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh2P15116 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh2P15116 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh2P15116 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh2P15116 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh2P15116 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh2P15116 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh2P15116 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh2P15116 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms