Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scd1P13516 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scd1P13516 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd1P13516 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd1P13516 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd1P13516 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scd1P13516 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scd1P13516 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scd1P13516 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scd1P13516 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.1 ms