Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UbbP0CG49 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UbbP0CG49 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms