Protein–RNA interactions for Protein: P0C1V4

Tmco2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco2P0C1V4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco2P0C1V4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco2P0C1V4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco2P0C1V4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco2P0C1V4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco2P0C1V4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco2P0C1V4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco2P0C1V4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco2P0C1V4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco2P0C1V4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco2P0C1V4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco2P0C1V4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco2P0C1V4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco2P0C1V4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms