Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb1bP06795 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb1bP06795 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb1bP06795 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb1bP06795 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcb1bP06795 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcb1bP06795 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms