Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myl1P05977 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myl1P05977 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myl1P05977 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Myl1P05977 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl1P05977 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myl1P05977 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myl1P05977 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myl1P05977 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myl1P05977 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myl1P05977 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myl1P05977 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Myl1P05977 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myl1P05977 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myl1P05977 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms