Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Got1P05201 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Got1P05201 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Got1P05201 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Got1P05201 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Got1P05201 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Got1P05201 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Got1P05201 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Got1P05201 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Got1P05201 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Got1P05201 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Got1P05201 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Got1P05201 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Got1P05201 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Got1P05201 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Got1P05201 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Got1P05201 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Got1P05201 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Got1P05201 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Got1P05201 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Got1P05201 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Got1P05201 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Got1P05201 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Got1P05201 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Got1P05201 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Got1P05201 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Got1P05201 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Got1P05201 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Got1P05201 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Got1P05201 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Got1P05201 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Got1P05201 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Got1P05201 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Got1P05201 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Got1P05201 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Got1P05201 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Got1P05201 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Got1P05201 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Got1P05201 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Got1P05201 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Got1P05201 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Got1P05201 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Got1P05201 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Got1P05201 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Got1P05201 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Got1P05201 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Got1P05201 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Got1P05201 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Got1P05201 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Got1P05201 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Got1P05201 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Got1P05201 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Got1P05201 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Got1P05201 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Got1P05201 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Got1P05201 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Got1P05201 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Got1P05201 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Got1P05201 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Got1P05201 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Got1P05201 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Got1P05201 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Got1P05201 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Got1P05201 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Got1P05201 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Got1P05201 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Got1P05201 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Got1P05201 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Got1P05201 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Got1P05201 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Got1P05201 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Got1P05201 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Got1P05201 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Got1P05201 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Got1P05201 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Got1P05201 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Got1P05201 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Got1P05201 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Got1P05201 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Got1P05201 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Got1P05201 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Got1P05201 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Got1P05201 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Got1P05201 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Got1P05201 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Got1P05201 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Got1P05201 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Got1P05201 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Got1P05201 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Got1P05201 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Got1P05201 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Got1P05201 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Got1P05201 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Got1P05201 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Got1P05201 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Got1P05201 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Got1P05201 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Got1P05201 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Got1P05201 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Got1P05201 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms