Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01664 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01664 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01664 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01664 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01664 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01664 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01664 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01664 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01664 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01664 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01664 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01664 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01664 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01664 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01664 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
P01664 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01664 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01664 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01664 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01664 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01664 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01664 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01664 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01664 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01664 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01664 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01664 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01664 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01664 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01664 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01664 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01664 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01664 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01664 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01664 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01664 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01664 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01664 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01664 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01664 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01664 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01664 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01664 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
P01664 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
P01664 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01664 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01664 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01664 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01664 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01664 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01664 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01664 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01664 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01664 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01664 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01664 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01664 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01664 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01664 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01664 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P01664 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P01664 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01664 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01664 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01664 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01664 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01664 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01664 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01664 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01664 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01664 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01664 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01664 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01664 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01664 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01664 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01664 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01664 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01664 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01664 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01664 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01664 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01664 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01664 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01664 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01664 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01664 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01664 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01664 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01664 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01664 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01664 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01664 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01664 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
P01664 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01664 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01664 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01664 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01664 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms