Protein–RNA interactions for Protein: O88811

Stam2, Signal transducing adapter molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stam2O88811 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stam2O88811 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stam2O88811 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stam2O88811 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stam2O88811 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stam2O88811 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stam2O88811 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stam2O88811 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stam2O88811 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stam2O88811 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stam2O88811 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stam2O88811 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stam2O88811 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stam2O88811 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stam2O88811 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stam2O88811 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stam2O88811 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stam2O88811 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stam2O88811 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stam2O88811 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stam2O88811 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms