Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Parp2O88554 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Parp2O88554 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Parp2O88554 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Parp2O88554 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Parp2O88554 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Parp2O88554 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Parp2O88554 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Parp2O88554 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Parp2O88554 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Parp2O88554 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms