Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nptx2O70340 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nptx2O70340 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nptx2O70340 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nptx2O70340 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nptx2O70340 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms