Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab33bO35963 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab33bO35963 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab33bO35963 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms